Problem1071--[视频]动态规划入门(二维一边推4:相似基因)

1071: [视频]动态规划入门(二维一边推4:相似基因)

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【问题描述】

匹配两个由A,C,G,T组成的基因,计算它们的相似度。相似度的计算方法如下:

 

A

C

G

T

-

A

5

-1

-2

-1

-3

C

-1

5

-3

-2

-4

G

-2

-3

5

-2

-2

T

-1

-2

-2

5

-1

-

-3

-4

-2

-1

*

例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,所以对应方法不唯一

例如:

A

G

T

G

A

T

-

G

-

G

T

-

-

T

A

G

相似度就是(-3)+ 5+  5 +(-2)+(-3)+ 5+ (-3)+5      =  9

例如又有:

A

G

T

G

A

T

G

-

G

T

T

A

-

G

相似度为:(-3)+ 5+   5+  (-2)+ 5+  (-1)+  5     =14。

要求相似度最大。

 

【输入文件】

共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,T四个字母。1<=序列的长度<=100。

【输出文件】

仅一行,即输入基因的相似度。

Sample Input Copy

7 AGTGATG
5 GTTAG

Sample Output Copy

14

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